Το MSMS μπορεί να παραμετροποιηθεί έτσι ώστε να εντάσσεται πλήρως σε ένα σύστημα Κρυπτογράφησης Δημοσίου Κλειδιού (PKI). Η φιλοσοφία ενός τέτοιου συστήματος είναι να εξασφαλίσει με ιδιαιτέρως αξιόπιστο τρόπο τη «μοναδικότητα» κάθε χρήστη του συστήματος και να του δώσει τη δυνατότητα να υπογράφει ψηφιακά τα έντυπα που χρησιμοποιεί ώστε να μη χρειάζεται η εκτύπωση, η υπογραφή τους με το συνήθη τρόπο και η αρχειοθέτησή τους.
Αν αυτό συνδυαστεί με τις αυτόματες ροές εργασίας που προσφέρει το MSMS, συμπεραίνουμε εύκολα ότι σε ένα πλήρως ανεπτυγμένο περιβάλλον οι χρήστες μπορούν να εργάζονται μόνο με αυτό.